После завершения башкирских восстаний, в 1728 году Уфимская провинция передана в непосредственное ведение Сената. В 1728 году делегация башкир во главе с Яркеем Янчуриным подало императору Петру II прошение «Об учинении розыска по поводу обид и притеснений, перенесенных ими от воевод и целовальников, и об охранении их вотчинных прав на земли», после которого вышел указ императора «Об отделении Уфимской провинции от Казанской губернии, о состоянии оной в особенном ведомстве Сената», согласно которому Уфимская провинция (кроме Мензелинска) была официально изъята из состава Казанской губернии и подчинена особому ведению Сената.
15 марта 1744 года Уфимская провинция была включена в состав новой учрежденной Оренбургской губернии.